大勢の観客が訪れた鈴鹿サーキットで行われたＦ１日本ＧＰ決勝。フリー走行、公式予選と合わせ、３日間の動員数が３６万１０００人。日本のＦ１ブーム絶頂期だった９４年の記録を抜き、過去最多となった。

晴れ／ドライコンディション
　
　20回目の開催をもっていったん幕を下ろす、鈴鹿での日本GPは、今シーズンを沸かせたフェルナンド・アロンソ（ルノー）、ミハエル・シューマッハ（フェラーリ）の新旧王者による同ポイントでのタイトル決定戦、“純日本”チームとして今季のF１に初参戦を果たしたSUPER AGURI F１チームの初の母国グランプリ、そしてHonda、トヨタの母国グランプリにおける表彰台を賭けた戦いなど、その歴史に相応しい見どころの多いレースとなった。
　
　決勝日の鈴鹿は午後２時のスタート時点で気温24℃、路面温度28℃のドライコンディション。22台のマシンはフォーメーションラップを終えると、秋晴れの下、53周のレースに臨んだ。好スタートを切ったのは５番グリッドのF.アロンソ。フェラーリとの間に入るトヨタの２台の背後にぴたりとつけると、１コーナーから２コーナーにかけてヤルノ・トゥルーリのイン側に並び、その出口で４番手に浮上する。一方、８番グリッドからスタートのルーベンス・バリチェッロ（Honda）が他車との接触でフロントウィングを破損し、修復のための緊急ピットインを余儀なくされ、最後尾まで落ちてしまう。
　
　３周目の１コーナーではM.シューマッハがチームメイトのフェリペ・マッサを交わしトップに浮上。この周にはファステストラップも記録し、２位以下とのタイム差を広げていく。一方、４番手を走行するF.アロンソは、ヘアピン、デグナーとオーバーランするシーンも見られたが、３番手のR.シューマッハとの差を徐々に詰めると、13周目の１コーナーの飛び込みでR.シューマッハをオーバーテイクし、３番手に浮上する。12周終了時にはJ.トゥルーリが上位陣で最初にピットに向かうと、翌周にはR.シューマッハとF.マッサ、その翌周にはF.アロンソ、M.シューマッハはその３周後に１回目のピットストップへと向かう。
　
　レースは中盤に向けてM.シューマッハがトップ、その約５秒後方をF.アロンソと、新旧王者がマッチレースを展開。その後方にF.マッサ、J.トゥルーリ、R.シューマッハのトヨタ勢が続くが、３ストップ戦略のトヨタは、29周終了時にJ.トゥルーリ、その翌周にR.シューマッハが２回目のピットイン。このピットストップで両者の位置関係は変わらなかったが、J.トゥルーリのマシンはマシンバランスを崩し、約10周に渡って著しくペースダウン。後ろを走るR.シューマッハもこの影響を受け、トヨタの２台は表彰台圏内から脱落してしまう。
　
　さらにレースに動きがあったのは、上位陣の２回目のピットストップ後。35周終了時に２番手のF.アロンソ、その翌周にトップのM.シューマッハが２回目のピットストップを行ない、それぞれ終盤に向けての優勝争いに備えるが、M.シューマッハはコースに復帰した周のデグナーカーブで何とマシン後部から激しい白煙を上げスローダウン。デグナーカーブを越えたところでコース脇にマシンを止めている。これでトップに立ったF.アロンソは２位のF.マッサに16.151秒差をつけてトップチェッカー。６月のカナダGP以来となる勝利を飾るとともに、M.シューマッハとのポイント差を『10』とし、自身２回目のドライバーズ・タイトル獲得に王手をかけている。
　
　この結果、優勝はF.アロンソ、２位にF.マッサ、３位にはジャンカルロ・フィジケラ（ルノー）が入り、母国グランプリを戦う日本勢では、Hondaのジェンソン・バトンの４位が最高位で、表彰台には届かなかった。５位はマクラーレン・メルセデスのキミ・ライッコネン、そして６位にJ.トゥルーリ、７位にR.シューマッハとトヨタ勢が続き、８位にはBMWザウバーのニック・ハイドフェルドが入った。
　
　“純日本”チームとして初の母国グランプリに臨んだSUPER AGURI F１チームは、鈴鹿の大観衆の声援を一身に受ける中、佐藤琢磨、山本左近の両ドライバーが53周先のチェッカーを目指して戦い、佐藤がトップから１周遅れの15位、山本がトップから３周遅れの17位と２台の揃っての完走を果たした。